院长（ 主任）：黄远林 ( 博士，教授，硕士生导师，平陆运河绿色工程专家，广西壮族自治区第十三届、十四届人大代表、广西人大环境与资源保护委员会委员，钦州市第三、四、五届人大代表、钦州市第六界政协常委，广西无人机技术应用协会副会长 )

主持学院（ 培训中心、船员培训中心 ）全面工作，主管培训工作（ 社会培训、教师培训、职业技能培训与鉴定、研学、无人机培训等 ）。

分管科室：继续教育科（ 培训科 ）、办公室、职业技能鉴定所。

副院长：封彬贤

负责后勤保障（ 包括国际交流中心餐厅、客房的管理等 ）、资产管理工作。

分管科室：国际交流中心。

副院长（ 副主任 ）：甘兆斌

负责船员培训、实验室管理工作。

分管科室：水上训练中心。

院长助理（ 副处级 ）：陈业启

负责学历教育（ 成高、自考 ）工作。

分管科室：学历教育科。